Как записать RSA с помощью МЧД написано по ссылке: Настройка УТМ для работы с МЧД

Инструкция

...

Запустите УТМ. Для этого нажмите на иконку с орлом в системном трее

право

Инструкция

Запустите УТМ. Для этого нажмите на иконку с орлом в системном трее правой кнопкой мыши и в выпадающем окне выберите «Запустить»
Перейдите на домашнюю страницу УТМ после того, как она запустится.
Это можно сделать через меню УТМ → "Домашняя страница" (в браузере откроется страница http://localhost:8080), либо, если порт УТМ нестандартный, в браузере открываем страницу http://localhost:*порт, указанный в файле “transport.properties”*. Файл по умолчанию находится по пути C:\UTM\transporter\conf
Использовать можно любой браузер, кроме Internet Explorer.
Перейдите в раздел "Генерация ключа доступа к ЕГАИС" на домашней странице УТМ.
Если ГОСТ сертификат на ключе оформлен на физическое лицо, то выберите из списка нужный вам вариант: «Руководитель ИП» или «Физическое лицо с машиночитаемой доверенностью».
Руководитель ИП сможет сразу записывать RSA, а для физического лица с машиночитаемой доверенностью необходимо добавить соответствующие файлы в поля «Выберите XML файл с машиночитаемой доверенностью» и «Выберите файл подписи машиночитаемой доверенности»
Если ГОСТ сертификат оформлен на юрлицо, то можно будет сразу приступить к записи RSA.
Выберите из списка RSA-ключ с нужным КПП и нажмите на него.
Поставьте галку на «Я принимаю условия выдачи ключей доступа к ЕГАИС» внизу страницы и нажмите «Сгенерировать сертификат».